受新冠疫情影響，日本全國多地的中小學在3月初相繼停課，隨著5月25日日本全境解除緊急狀態，日本各地的學校也逐漸復課。

根據日本文部科學省6月3日公布的數據來看，截至6月1日，日本全國98%的幼兒園、中小學及特殊教育學校等已復課。其中，公立學校的復課率達99%。

公立學校中，已完全恢復正常授課的占55%，只在上午授課的占17%，為減少同時在校人數而實施“分散上課”(按年級和班級等錯開上課時間)的約占27%。而未完全恢復正常授課的大多數學校表示，將陸續在6月中下旬恢復正常的教學秩序。

從地域來看，大阪府、福井縣等5府縣大部分的府立、縣立學校實行縮短教學時間的復課，而東京都、千葉縣、神奈川縣等10都縣則實施“分散上課”。

為了防止疫情復燃，日本文部科學省向各地教育委員會發布了以“學校的新生活方式”為題的衛生管理指南，將地區的感染風險分為3個等級，內容涉及保持距離的方法、可開展的教學及社團活動等。

學校方面也保持“高度戒備”狀態，在福岡縣粨屋町的粨屋中學，老師和學生們不僅戴著口罩，在上課前還都領到了防護面罩。據稱，學校每天都會對防護面罩進行消毒。

一名男同學表示：“雖然戴著這個東西不方便，但是能夠讓人安心。”女同學也表示：“雖然今后逐漸熱起來了，有點擔心戴著會難受，但是大家又能夠一起到校學習了，還是很高興的。”

福井縣永平寺町的上志比小學，學生們帶著口罩來到學校后，一進教室就馬上洗手，此外，老師還會對學生們的體溫和家人的健康狀況進行確認，為了防控疫情，學校還將原本的兩人并排坐改成了一個人坐，教室通風換氣也貫徹到底。

因為停課時間過長，目前日本各個學校也在設法補齊學生因長期停課而落下的學習進度。

這次日本長時間的停課 產生了諸多問題， 之前日本社會也出現了針對“9月開學”問題的爭論。

據最新消息，日本首相安倍在6月1日和2日，接連與自民黨及公明黨議員就“9月入學”問題進行了會談。自民黨向安倍提交了一份建言書，其中指出，引進9月入學制度必須經過全體國民的同意，需要一定時間才能付諸實施，因此不宜操之過急。

鑒于此，安倍表示，“目前正值緊急事態宣言解除，中央及地方政府等致力于保障教學環境的時期，在本年度或明年度修改相關法律并引進新的制度十分困難”，以此表示不會在本年度或明年度實施9月入學制度。

有報道稱，日本文部科學省將在這一意向的基礎上，最早于本周內公布相關應對方針，以致力于讓學生趕上被耽誤的學習進度。據介紹，即將公布的方針中，包括舉例說明應優先進行的教學內容、利用暑假及周六追趕進度以及將本年度沒有完成的學習內容延到下一年度進行等。

另一方面，也有意見認為，推行國際通用的“9月入學制”能夠提升學生赴海外留學的意愿，促進歸國子女就業，從而提高日本的國際競爭力。鑒于此，日本政府計劃與執政黨一道，將此作為一個長期課題繼續進行探討。